Той загинув під час звільнення села П’ятихатки на Запоріжжі від російських окупантів.
Як повідомляє міський голова Олександр Третяк, герой пішов на фронт, щоб захистити своїх дітей:
– Завзятий українець, щирий патріот своєї країни, турботливий батько, прекрасний чоловік та відважний воїн…Саме таким був Анатолій Пупенко. Він розумів, що ніхто, крім нас не збудує країни і не буде боротися за нашу свободу. Тому від початку АТО зі зброєю в руках захищав суверенність України.
