Священний Синод – вищий орган управління церквою. До його складу входить митрополит Київський Епіфаній та 12 єпархіальних архієреїв, частина з яких обрана на постійній основі (на рік), а частина змінюватиметься кожного синодального періоду: зимового (1 вересня – 28-29 лютого) та літнього (1 березня – 31 серпня).
Архієпископ Рівненський та Острозький Іларіон став тимчасовим членом Синоду Помісної Української православної Церкви.
5 лютого у Митрополичому будинку при Соборі Святої Софії Київської відбулося перше засідання Священного Синоду.
Під час засідання було затверджено титули архієреїв Помісної Церкви, встановлено порядок найменування єпархій у разі, якщо ці найменування дублюються – у такому випадку єпархія іменується відповідно до подвійного титулу архієрея.
Релігійні організації, які входили до складу кожної єпархії станом на 15 грудня 2018 р, залишаються у складі відповідної єпархії. Перехід духовенства і парафій між єпархіями Помісної Церкви можливий лише на основі канонічних правил, тобто за згодою архієреїв обох єпархій, посвідченою відповідними документами, повідомляє Рівненська єпархія ПЦУ.